產(chǎn)品分類(lèi)
DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù)：聚合酶鏈反應(yīng)構(gòu)建重組DNA
更新時(shí)間：2013-09-04 瀏覽次數(shù)：2096
利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR），任何兩個(gè)DNA片段可連接成一個(gè)新的重組DNA分子。通過(guò)在PCR引物中引入的額外非同源的核苷酸，可在連接處產(chǎn)生所需要的讀碼框架或酶切位點(diǎn)。用該技術(shù)并不需要知道待亞克隆的DNA的核苷酸序列，只需要知道兩小段伸展于片段兩倆的區(qū)段作為擴(kuò)增反應(yīng)的引物結(jié)合區(qū)。
實(shí)驗(yàn)方法
- 基本方案
| 實(shí)驗(yàn)材料 | DNA |
|---|---|
| 試劑、試劑盒 | TE 無(wú)水乙醇 DNA聚合酶 CTP |
| 儀器、耗材 | 電泳儀 離心機(jī) PCR儀 |
| 實(shí)驗(yàn)步驟 | 1. 制備模板DNA，如DNA不是經(jīng)氯化銫梯度純化的，100℃煮沸10 min 以滅活核酸酶。 2. 制備寡核苷酸引物，若PCR產(chǎn)物要進(jìn)行平端克隆，就應(yīng)該對(duì)引物的5’端羥基進(jìn)行磷酸化處理。  圖一、用PCR反應(yīng)引入單一的酶切微點(diǎn)和產(chǎn)生符合讀碼框架的融合蛋白。 3. 建立標(biāo)準(zhǔn)的擴(kuò)增反應(yīng)，以礦物油覆蓋表面，在以下條件下進(jìn)行20~25輪擴(kuò)增循環(huán)：94℃變性1 min，50℃退火1 min，72℃延伸3 min，zui后一個(gè)循環(huán)在72℃延伸10 min 盡可能使擴(kuò)增產(chǎn)物完整。  圖二、序貫PCR法構(gòu)建重組DNA分子，引物1b與基因2同源區(qū)域；引物1c有與基因1同源區(qū)域 4. 取少量反應(yīng)混合物（4~8 μl），用瓊脂糖凝膠電泳或聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增效果。 5. 吸去礦物油上層，用氯仿抽提1次除去殘存的礦物油，用飽和酚抽提1次，然后用無(wú)水乙醇沉淀DNA。  圖三、用反向PCR插入酶切位點(diǎn) 6. 4℃高速離心10 min，沉淀用20 μl TE緩沖液溶解。 7. 用玻璃珠，電冼脫或低融點(diǎn)膠的酚抽法進(jìn)一步純化PCR產(chǎn)物可去除未摻入dNTP引物、無(wú)關(guān)的PCR產(chǎn)物和模板DNA。 8. 對(duì)于通過(guò)平端連接進(jìn)行的克隆：用DNA聚合酶I （或klenow酶）修平擴(kuò)增片段的3‘末端。 9. 對(duì)于通過(guò)粘端連接進(jìn)行的克隆：在20 μl 體積用合適的酶消化一半PCR只產(chǎn)物，用過(guò)量的酶消化數(shù)小時(shí)。 10. 用合適的末端互補(bǔ)的酶在20 μl 體積內(nèi)消化0.2~2 μg 載體DNA，用CIP去瞵酸化，以阻止載體自連。 11. 用普通瓊脂糖或低融點(diǎn)瓊脂溏電泳分離線(xiàn)性化的載體。 12. 用玻璃珠、電洗脫、或酚抽法回收線(xiàn)狀的載體。 13. 連接PCR片段和線(xiàn)狀載體。 14. 取部分連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大楊桿菌，從轉(zhuǎn)化體集中以小量制備法提取質(zhì)粒DNA。 15. 用合適的酶消化轉(zhuǎn)化體的質(zhì)粒DNA，以瓊脂糖凝膠電泳分析以確證片段的插人。 16. 測(cè)定質(zhì)粒DNA中擴(kuò)增片段的序列，檢查有無(wú)突變，或者用生物化學(xué)或遺傳學(xué)方面的功能分祈篩選轉(zhuǎn)化體。 |